倒置显微镜就是指物镜与照明系统颠倒，物镜在下，物体在上来进行观察的光学显微镜。大致可分为生物倒置显微镜、金相倒置显微镜、偏光倒置显微镜、荧光倒置显微镜等。多应用于医疗卫生单位、高等院校、研究所等对微生物、细胞、细菌、组织培养、悬浮提、沉淀物等的观察以及细菌的繁殖分裂等领域。
倒置显微镜的优点在于容易制样(只需观察面磨平)，载物台上方空间大，对于大样品的研究分析有着显著的优势，倒置生物显微镜的应用，对于培养皿中各细胞以及微生物的分裂等有着极其重要的意义。倒置显微镜的自由度大于正置显微镜。
正置显微镜就是指物镜在上，物体在下，照明在下的常规光学显微镜，与倒置显微镜恰恰相反，其分类也十分丰富。各领域的应用中均有正置显微镜的身影，正置显微镜是应用最多的显微镜。
正置显微镜的优点就是方便、快捷，满足大多数人的使用习惯和要求，使得操作更顺手。但在实际观察中需要将样品放平，因此其对样品的自由度要求较高，要尽量满足观察要求，要有正确的操作方法。
其实，用户在选择显微镜的时候，就已经确立了自己的使用要求，在确立要求之后，选择何种显微镜已经一目了然，两者各有特点，应用效果均很理想，如若将两者搭配使用，则更趋于完美。（来源网络）
